Daily Journal Digest — 2026-06-28¶
過去 24 小時新增：Transplant ID × 6、One Health × 12、Food Security × 11，共 29 篇。
⭐ 今日亮點¶
- From the Eye of the Storm to Epidemiological Footprints After the Floods: Viral, Vector-Borne, and One Health Risks Post-Hurricane Melissa in Jamaica
用系統思考剖析風災後 AMR 與人畜共通症的級聯風險與調適框架。 - Genomic characterization of the convergence of multidrug resistance and virulence in Salmonella Enteritidis from a broiler slaughterhouse in China
沙門氏菌 WGS 研究，揭示毒力與抗藥共存之跨域傳播警訊。 - Isavuconazole as primary antifungal prophylaxis in pediatric hematological patients: a clinical and pharmacokinetic analysis
提供兒童移植預防真菌之抗黴菌藥濃度監測與安全性臨床資料。
🔬 深入評讀¶
From the Eye of the Storm to Epidemiological Footprints After the Floods: Viral, Vector-Borne, and One Health Risks Post-Hurricane Melissa in Jamaica¶
Viruses | IF 4.0 | DOI
- 設計：本篇為觀點（Perspective）評述，運用系統思考、PESTHEEL 架構與 One Health 觀點，探討牙買加在 Category 5 的 Hurricane Melissa 風災後所面臨的公衛與生物安全風險。文章結合歷年實證文獻與官方通報，系統性剖析水媒、病媒傳播疾病與人畜共通傳染病等多重威脅之因果回饋與時間延遲效應。
- 樣本：分析涵蓋牙買加約 280 萬總人口（150 萬人直接受災）及超過 100 萬隻死亡牲畜之生態影響，並回顧 1999 年至 2025 年間美國北卡羅萊納州與波多黎各等風災前例。文中重點探討 Leptospira spp.、Aedes aegypti、Angiostrongylus cantonensis 以及 Oropouche virus 等病原在極端氣候下的傳播機制。
- 關鍵數字：截至 2025 年 11 月 26 日，牙買加通報 39 例 Leptospira 疑似或確診病例（含 10 例死亡，其中 6 例確診），而登革熱雖有 452 例疑似病例，但確診數為 0，顯示急性水媒傳染病的災後效應顯著且穩健，而病媒傳播疫情則受控於介入措施而尚無爆發跡象。此結果與美洲同年截至 EW 33 累計 212,029 例 Chikungunya 疑似病例（含 245 例死亡，巴西 n = 425,773 例）所顯示的區域高傳播效應呼應。
- Limitation：主要方法學限制為牙買加當地的量化資料缺乏（data poverty），導致部分風險路徑分析必須以美國 Floyd 及 Katrina 等風災的歷史代理資料（proxy）進行推論，可能限制了結論在加勒比海小島國的適用性。
- Bottom line：災後臨床與公衛防線必須超越單一學科，即刻建立整合臨床 syndromic、實驗室及病媒監測的 One Health 聯防機制，方能有效因應氣候變遷引發的連鎖性感染風險。
Genomic characterization of the convergence of multidrug resistance and virulence in Salmonella Enteritidis from a broiler slaughterhouse in China¶
Int J Food Microbiol | IF 7.0 | DOI
- 設計：本研究為 1 項在中國四川進行的單一屠宰場流行病學與基因體監測研究。
- 樣本：針對 175 株分離株進行抗藥性測試，並挑選其中 61 株代表性菌株進行全基因體定序（WGS）。
- 關鍵數字：發現高達 98.86% 的菌株具備多重抗藥性（MDR），且 96.72% 攜帶 blaCTX-M-14 基因，抗藥與毒力因子共存之效應量極大且菌株抗藥表現穩健。
- Limitation：局限於 1 家屠宰場的橫斷面採樣，缺乏與同期人體臨床感染源之 1 對 1 系統性親緣關係比對。
- Bottom line：家禽供應鏈中已出現 1 種兼具高毒力與 ESBL 抗藥性的 Salmonella 菌株，亟需跨領域的 One Health 介入策略。
Isavuconazole as primary antifungal prophylaxis in pediatric hematological patients: a clinical and pharmacokinetic analysis¶
Antimicrob Agents Chemother | IF 4.1 | DOI | [(Baccell2026Isavuconazoleprimary?)]
- 設計：本研究為一項單一中心、回溯性的觀察性研究，評估 2021 年 1 月至 2025 年 4 月期間小兒血液病或造血幹細胞移植患者，使用 off-label 的 isavuconazole 作為第一線預防性抗黴菌藥物之臨床與藥物動力學表現。
- 樣本：樣本包含 21 名中位年齡 9.6 歲（範圍 3.0-18.0 歲）的小兒患者，其中 17 名（77.3%）接受異體造血幹細胞移植，追蹤時間中位數為 23 個月（IQR 15-39）。
- 關鍵數字：在 188 次 TDM 監測中，94.1% 的 Cmin 落在 1.0-5.0 mg/L 之預設目標區間且無須調整劑量，且追蹤期間的突破性 IFD 發生率為 0%。此一高達 95.2% 首次測量即達標的比率，證實 isavuconazole 在預防情境下具有極佳的藥物動力學穩定性與穩健的臨床保護效力。
- Limitation：本研究的主要限制為單一中心回溯性設計且樣本數較小（n = 21），降低了研究結論對其他醫療機構的外推性。此外，研究未對併用藥物進行 TDM 監測，使得無法完全釐清藥物交互作用的細節。
- Bottom line：針對高風險小兒血液病或造血幹細胞移植患者，isavuconazole 是一項兼具穩定暴露量與良好安全性的第一線預防性抗黴菌藥物，特別適合防範 Aspergillus 感染且須併用經由 CYP3A4 代謝之免疫抑制劑的臨床情境。
🔴 Transplant & Opportunistic Infections¶
Isavuconazole as primary antifungal prophylaxis in pediatric hematological patients: a clinical and pharmacokinetic analysis¶
Authors: Baccelli F et al. | Journal: Antimicrob Agents Chemother | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1128/aac.00451-26
TL;DR: 回顧分析21名接受isavuconazole作為primary AFP的血液病童，無人發生breakthrough IFD，且首次TDM達標率為95.2%，在兒童中具備良好安全性與穩定的藥物暴露。
嘻嘻：兒童血液病患用isavuconazole預防真菌感染效果佳，TDM達標率超高！
Diagnosing lung disorder and optimal classification using dense convolution (Dc)-CapsNet technique¶
Authors: Lim SJ et al. | Journal: Sci Rep | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1038/s41598-026-58006-y
TL;DR: 全新DC-CapsNet模型診斷肺癌、pneumonia及tuberculosis的準確度達97.58%（precision 0.986，recall 0.975），表現優於現有傳統模型。
嘻嘻：全新DC-CapsNet診斷部疾病準確度破九成七，AI篩檢越來越猛了。
Rifampicin resistance and associated factors of Mycobacterium tuberculosis among pulmonary tuberculosis-suspected patients in the Amhara National Regional State Comprehensive Specialized Hospitals, Ethiopia¶
Authors: Dilnessa T et al. | Journal: PLoS One | Date: 2026
DOI: 10.1371/journal.pone.0351964
TL;DR: 衣索比亞2548名疑似PTB患者中，Mycobacterium tuberculosis陽性率為5.9%，其中12.7%具rifampicin resistance，且與HIV-positivity相關。
不嘻嘻：M. tuberculosis對rifampicin抗藥性高，合併HIV真的有夠棘手。
Artificial intelligence-based prediction of diseases among homeless populations in Bogotá: Implications for targeted interventions¶
Authors: Ordoñez H et al. | Journal: PLoS One | Date: 2026
DOI: 10.1371/journal.pone.0352268
TL;DR: 利用波哥大10,478名無家可歸者的普查資料，以XGBoost模型預測罹病風險，準確度達0.91、F1-score為0.70，其中hypertension與HIV/AIDS為主要預測指標。
嘻嘻：用XGBoost預測無家可歸者的罹病風險，準確度破九成，能精準早期介入。
Prevalence of allergic bronchopulmonary aspergillosis/Aspergillus sensitization in chronic obstructive pulmonary disease: A systematic review and meta-analysis¶
Authors: Ajayababu A et al. | Journal: Respir Investig | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1016/j.resinv.2026.101469
TL;DR: COPD患者中，ABPA與Aspergillus sensitization的合併盛行率分別為2.1% (95% CI: 0.1-5.8%) 與10.4% (95% CI: 7.0-14.3%)。
不嘻嘻：COPD患者有一成對Aspergillus致敏，難怪這些人喘起來要人命。
A disciplinary alliance between obstetrics and infectious diseases: Building integrated perinatal safety systems¶
Authors: Korchynska OO et al. | Journal: Wiad Lek | Date: 2026
DOI: 10.36740/WLek/220829
TL;DR: 彙整30篇文獻，將感染科專業整合至產科照護，能提升診斷精準度、加速正確治療並強化antimicrobial stewardship，進而改善母嬰感染預後。
嘻嘻：產科跟感染科合作無間，不僅能改善母嬰感染預後，還能落實抗藥性管理。
🟢 One Health / Zoonoses¶
Genomic characterization of the convergence of multidrug resistance and virulence in Salmonella Enteritidis from a broiler slaughterhouse in China¶
Authors: Han X et al. | Journal: Int J Food Microbiol | Date: 2026 Jun 21
DOI: 10.1016/j.ijfoodmicro.2026.111920
TL;DR: 中國四川175株Salmonella Enteritidis屠宰場分離株中，98.86%具multidrug resistance；61株定序證實均攜帶完整毒力因子且逾96%具blaCTX-M-14。
不嘻嘻：屠宰場的Salmonella Enteritidis幾乎全具多重抗藥性，真的會嚇死。
One Health Genomic Surveillance at Human-Animal Interfaces in Rural Ghana Reveals Underreported Viruses of Zoonotic and Economic Concern¶
Authors: Paoli JE et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 Jun 03
DOI: 10.3390/v18060644
TL;DR: 在迦納5個地區篩檢165隻動物，metagenomic surveillance首次獲取porcine parvovirus 3及canine parvovirus基因組，並證實rotavirus具跨物種傳播。
不嘻嘻：豬狗的細小病毒在迦納現蹤且輪狀病毒跨物種傳播，人畜共通防不勝防。
Nationwide Detection and Molecular Characterization of Hepatitis E Virus RNA in Retail Pork Meat in Japan¶
Authors: Takahashi M et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 May 29
DOI: 10.3390/v18060621
TL;DR: 在日本8個地區收集1546份零售豬肉樣品，15份（1.0%）檢出HEV RNA，其中以subtype 3b佔多數（7份），國產與進口肉品之陽性率均為1.0%。
不嘻嘻：日本零售豬肉有一%驗出HEV，愛吃生豬肉的人皮真的要繃緊一點。
From the Eye of the Storm to Epidemiological Footprints After the Floods: Viral, Vector-Borne, and One Health Risks Post-Hurricane Melissa in Jamaica¶
Authors: Douglas KO et al. | Journal: Viruses | Date: 2026 May 26
DOI: 10.3390/v18060605
TL;DR: 牙買加遭五級颶風重創並損失百萬牲畜，引發waterborne與vector-borne diseases、zoonoses及antimicrobial resistance等威脅。
不嘻嘻：颶風過後不只淹水，還要面臨水媒與病媒疾病、抗藥性細菌的夾擊。
Toxicants, Exposome, and Hantavirus Disease: A One Health Perspective¶
Authors: Domingo JL | Journal: Viruses | Date: 2026 May 25
DOI: 10.3390/v18060597
TL;DR: 從One Health角度探討環境毒素與exposome如何透過免疫失調與內皮功能障礙等機制，影響hantavirus disease（特別是ANDV）的易感性與疾病嚴重度。
不嘻嘻：環境毒素還會讓人更容易得hantavirus，大自然給我們的考驗真多。
Pesticide Use and Safety Behaviors Among Farmers in Rwanda's Eastern Province: Perspectives from Sector Officers on Drivers, Factors, and Gender Differences¶
Authors: Irimaso E et al. | Journal: Int J Environ Res Public Health | Date: 2026 Jun 08
DOI: 10.3390/ijerph23060771
TL;DR: 藉與盧安達東部省31位農業官員討論，指出農民因過度使用abamectin等6種常見農藥而面臨健康風險，並有助長害蟲產生pest resistance之虞。
不嘻嘻：盧安達農民過度使用農藥害得害蟲產生抗藥性，真的是惡性循環。
Eco-epidemiology and zoonotic implication of intestinal nematode parasites in humans and dogs in West Shoa Zone, Ethiopia¶
Authors: Chemeda R et al. | Journal: Sci Rep | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1038/s41598-026-58809-z
TL;DR: 衣索比亞西謝瓦地區310隻犬中，55.2%檢出人畜共通nematodes，以Ancylostoma caninum（31.3%）最盛行，但僅26%飼主具防範意識。
不嘻嘻：狗身上滿是Ancylostoma caninum但飼主毫無防範意識，真的會傳人。
A drug repurposing screen identifies antiviral compounds against Puumala Orthohantavirus¶
Authors: Christ W et al. | Journal: Sci Rep | Date: 2026 Jun 25
DOI: 10.1038/s41598-026-57843-1
TL;DR: 利用活性PUUV進行老藥新用篩選，在A549與內皮細胞中鑑定出70種具抗病毒活性的候選藥物，包含heat shock proteins與mTOR途徑抑制劑。
嘻嘻：老藥新用篩選出七十種具抗hantavirus活性的藥物，新療法有譜了。
Extended-spectrum beta-lactamases from French veal calves: WGS-based data will help build targeted AMR mitigation strategies¶
Authors: Haenni M et al. | Journal: Microbiol Spectr | Date: 2026 Jun 22
DOI: 10.1128/spectrum.00659-26
TL;DR: 法國小牛在原農場的ESC-R Escherichia coli攜帶率為12.5%。定序176株分離株發現，55.1%具ESBL表型，餵食廢奶為主要風險。
不嘻嘻：法國小牛常帶ESBL型E. coli，居然是因為餵牠們喝廢奶。
Do One Health Networks Compete, Coordinate, or Both? Insights from a Cross-Network Dialogue¶
Authors: Lam S et al. | Journal: Ecohealth | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1007/s10393-026-01818-1
TL;DR: 透過多方跨網路對話，分析全球不同One Health團隊與網路在資源爭奪與合作目標上的競爭及協調關係，藉此促進跨領域合作。
不嘻嘻：全球One Health團隊搶資源搶到破頭，講好的跨領域合作呢？
Culture-Based Assessment of Presumptive Resistant Bacterial Taxa in the Urban Danube River near Novi Sad: Environmental Associations Revealed by Machine Learning¶
Authors: Jovićević M et al. | Journal: Antibiotics (Basel) | Date: 2026 May 30
DOI: 10.3390/antibiotics15060553
TL;DR: 利用機器學習分析2024年多瑙河諾維薩德段水體，發現廢水樣本具較高抗藥菌豐度，且其分布與有機污染指標、濁度、pH及水溫密切相關。
不嘻嘻：多瑙河畔浪漫不再，機器學習證實廢水排入處全是滿滿的抗藥性細菌。
Antimicrobial Resistance and Genomic Characterization of Four mcr-1-Harbouring Foodborne Salmonella Isolates Recovered from Poultry in Saudi Arabia¶
Authors: Alsufyani AT et al. | Journal: Antibiotics (Basel) | Date: 2026 May 29
DOI: 10.3390/antibiotics15060545
TL;DR: 沙烏地阿拉伯4株mcr-1陽性Salmonella分離株均呈multidrug resistance與colistin抗性，且mcr-1基因位於質體上。
不嘻嘻：Salmonella帶有mcr-1基因，連最後一線colistin都快沒用了。
🟡 Food Security / Food Safety¶
Integrating 3D phenotyping and functional-structural plant models for crop ideotype breeding¶
Authors: Wei Q et al. | Journal: Nat Commun | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1038/s41467-026-74679-5
TL;DR: 提出整合三維架構表型分析與功能性結構植物模型的架構，將作物理想型育種從傳統經驗驅動轉為預測性設計，有助於提高產量與資源利用效率。
嘻嘻：作物育種也用上3D表型預測，期待未來能培育出更抗病的高產量作物。
Adverse Outcome Pathway Frameworks for Dietary Contaminants: Bridging Mechanistic Toxicology with Regulatory Food Safety¶
Authors: Pamanji R | Journal: Food Chem Toxicol | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1016/j.fct.2026.116240
TL;DR: 評估膳食污染物（如真菌毒素、重金屬等）的AOP框架，指出當前研究與監管應用間存在落差，並提出加強定量資料與混合毒性評估的建議。
不嘻嘻：膳食污染物監管與學術研究有落差，我們每天到底都吃進了什麼毒素。
Underlying export characteristics and projected country positions in the agri-food trade: A global system analysis¶
Authors: Ghozatfar A et al. | Journal: NPJ Sci Food | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1038/s41538-026-00944-y
TL;DR: 利用機器學習分析25國在1988至2022年間的農食出口，預測至2035年，美國、荷蘭、巴西、德國、中國與澳洲將持續領先出口。
嘻嘻：機器學習預測美荷巴德中澳將持續稱霸農食出口，糧食供應鏈安全有保障。
Fluoride Toxicodynamics and Interactions with Co-Contaminants: Mechanistic Insights with Implications for Agricultural Systems and Food Safety¶
Authors: Meng H et al. | Journal: J Agric Food Chem | Date: 2026 Jun 27
DOI: 10.1021/acs.jafc.6c01386
TL;DR: 綜述氟在農業與畜牧業中的毒物動力學及多元素交互作用，指出必需微量營養素可減輕其毒性，而其他協同毒物則會加劇其造成的器官損傷。
不嘻嘻：農業中的氟毒性會被協同毒物加劇，看來農食安全又要亮紅燈了。
A high-resolution gridded dataset of biomass resource potentials in China with policy-aware land-use constraints for renewable energy planning¶
Authors: Huang L et al. | Journal: Sci Data | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1038/s41597-026-07689-z
TL;DR: 開發中國1公里高解析度生質能資源潛力網格資料集（2020-2050年），融合糧食安全與生態保育限制，為再生能源規劃提供決策支持。
嘻嘻：高解析度生質能資源資料集問世，綠能規劃終於有精準的決策支持了。
Clinical, lifestyle, environmental and dietary determinants of malnutrition in adolescents on antiretroviral therapy in Ethiopia¶
Authors: Bore MG et al. | Journal: PLOS Glob Public Health | Date: 2026
DOI: 10.1371/journal.pgph.0005003
TL;DR: 衣索比亞384名接受ART的HIV青少年感染者中，thinness及acute malnutrition盛行率分別為24.2%與34.9%，糧食不安全為其危險因子。
不嘻嘻：衣索比亞青少年HIV感染者面臨缺糧，營養不良率高到令人心痛。
Multi-modal deep learning for paddy health assessment: fusing leaf imagery with tabular metadata using a factorized bilinear pooling approach¶
Authors: V VG et al. | Journal: Sci Rep | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1038/s41598-026-52281-5
TL;DR: 提出MFBP多模態深度學習模型，融合水稻葉片影像與分類資料，在含有萬餘張影像之資料集上展示了優於傳統串接融合之病害分類成效。
嘻嘻：多模態深度學習用在水稻病害分類，準確度大幅提升，農夫的救星來了。
Basil essential oil induces multifactorial stress in Klebsiella variicola: A potential natural strategy to control a foodborne pathogen¶
Authors: Pavone V et al. | Journal: J Appl Microbiol | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1093/jambio/lxag152
TL;DR: 使用定量proteomic分析，發現BEO會誘發Klebsiella variicola產生膜恆定失調與氧化壓力等多重逆境，具開發為天然抗菌策略之潛力。
嘻嘻：九層塔精油能破壞K. variicola，天然抗菌策略很有希望。
Growth, instability and future outlook of livestock population and products in Bangladesh¶
Authors: Islam AHMS et al. | Journal: PLoS One | Date: 2026
DOI: 10.1371/journal.pone.0351876
TL;DR: 利用ARIMA模型預測孟加拉至2041年的家畜產量，預估牛乳、肉類與蛋類產量將分別比2020年增長24.34%、35.24%與61.51%。
嘻嘻：預測孟加拉未來乳肉蛋產量大幅增長，當地的營養供應應該會大幅改善。
Entomopathogenic effect of Beauveria bassiana on Phlebotomus perniciosus (Diptera: Psychodidae)¶
Authors: Guesser JVC et al. | Journal: Acta Trop | Date: 2026 Jun 25
DOI: 10.1016/j.actatropica.2026.108201
TL;DR: Beauveria bassiana可顯著縮短Phlebotomus perniciosus雌成蟲半數壽命，且將其產卵量自30.4顆降至5.9顆。
嘻嘻：B. bassiana能讓P. perniciosus少生早死，生物防治效果讚。
Class-Incremental Learning for Foodborne Pathogen Prediction Based on Clinical Surveillance Data¶
Authors: Qin K et al. | Journal: J Food Prot | Date: 2026 Jun 26
DOI: 10.1016/j.jfp.2026.100847
TL;DR: 開發CIL-DAFFNet增量學習模型，預測Salmonella與Norovirus等病原，於臨床資料集取得0.8245的準確度與0.8004的Macro-F1。
嘻嘻：用增量學習預測Salmonella與諾羅病毒，臨床防範食物中毒更精準。
資料來源：PubMed (articles retrieved 2026-06-28)