Daily Journal Digest — 2026-06-26¶
過去 24 小時新增：Transplant ID × 27、One Health × 15、Food Security × 12，共 54 篇。
⭐ 今日亮點¶
- Addressing the zoonotic threat of merbecoviruses
旗艦級新興人畜共通框架，受體拓寬警示 spillover - Population genomics reveals a long-term increase in azole resistance associated with the emerging cluster AZR among Candida tropicalis causing invasive infections
AMR 核心：單一 clone 驅動 azole 抗藥破 40% - Persistent and pathogen-specific infection risk during long-term survivorship after CD19 CAR-T: An Australian multi-centre cohort study
細胞治療 OI：晚發感染逾年，類固醇定真菌風險
🔬 深入評讀¶
Addressing the zoonotic threat of merbecoviruses¶
Nat Microbiol | IF 20.5 | DOI | [(Li2026Addressingzoonotic?)]
- 設計：Nat Microbiol 綜述（Review Article，2026-06-24 線上）—非原始研究、無統合分析；以 merbecovirus 受體使用為主軸，整合分子病毒學、結構生物學與監測資料，論證流行病大流行整備（診斷、廣效抗病毒藥、泛冠狀病毒疫苗）。
- 樣本：涵蓋自 2012 年現身的 MERS-CoV（ECDC 統計區間 2012-04 至 2026-02；單一沙烏地大型分析納入 6,873 名疑似個案）及其近緣物種譜系，宿主跨單峰駱駝、蝙蝠、刺蝟（Erinaceus）、穿山甲（Manis）、水貂與貂類等；關鍵原始研究包括 Xiong 2022（Nature 612:748）、HKU5 lineage 2（Chen 2025 Cell）、HKU25 clade（Liu 2025 Nat Microbiol 10:2860）、水貂 MERS 樣病毒（Wang 2025 Nature 642:739）與刺蝟 merbecovirus 用 APN 的 2025 bioRxiv 預印本。
- 關鍵數字：核心訊息為受體庫的擴張：merbecovirus 不再僅依賴 DPP4，多個成員可改用 ACE2（HKU5 lineage 2 甚至能用 human ACE2）或 aminopeptidase N（APN，刺蝟譜系），此「趨同演化」多次獨立發生（Ma 2025 Cell）。就跨種外溢風險而言效應方向明確且具結構證據支持，但屬定性機制論述、非量化發生率，能否真正高效感染人類仍待證實。
- Limitation：綜述本質上未做統合或合併估計；多數受體結論來自 in vitro 假病毒／結合實驗與動物（hDPP4-transgenic mice、rhesus macaque）模型，部分關鍵 APN 證據僅為未經同儕審查之預印本；human ACE2 使用是否等同臨床致病力、傳播力，現有資料無法直接外推。
- Bottom line：MERS-CoV 之外的 merbecovirus 已具備 DPP4／ACE2／APN 多受體可塑性與跨種外溢潛力，臨床與公衛端應提前佈署廣效診斷、泛冠狀病毒疫苗與廣效抗病毒藥，於外溢早期即偵測與圍堵。
Population genomics reveals a long-term increase in azole resistance associated with the emerging cluster AZR among Candida tropicalis causing invasive infections¶
Emerg Microbes Infect | IF 8.4 | DOI
- 設計：中國 CHIF-NET 全國性、實驗室為基礎的多中心被動式侵襲性念珠菌病監測研究，結合 Sensititre YeastOne 抗黴菌藥敏與族群基因體學（whole genome sequencing）；本期納入 2022–2023 年（CHIF-NET22-23）橫斷面資料，並對 2009–2023 年共 604 株做比較性族群基因體分析，本質為回溯性監測。
- 樣本：CHIF-NET22-23 共收集 911 株 Candida tropicalis（占全部 Candida 16.1%，第三常見），來自 28 省 49 家醫院；其中血液培養 408 株（44.8%）；WGS 子集 604 株（448 株來自先前研究＋本研究新定序 156 株，採分層隨機抽樣），涵蓋 14 個監測年度的縱貫趨勢比較。
- 關鍵數字：fluconazole 抗藥率達 42.3%（385/911）、voriconazole 37.2%，FLU-抗藥株中 87.5% 對 VOR 交叉抗藥；candidemia 抗藥率顯著高於非 candidemia（46.1% vs 39.2%，p=0.036），內科部門最高（55.0%）而 ICU 較低（33.7%，adj p<0.001）；自 2009 年約 4.4–5.7% 一路攀升、2020–2021 短暫回落後反彈，2022 年達史上高峰 43.1%（Cochran-Armitage p<0.001）；族群基因體顯示 cluster AZR 為主要抗藥族群（FLU-抗藥株中 58.6%，近四年升至 62.3%），全數帶 ERG11 A395T（Y132F）關鍵突變、98.2% ERG11 copy number 增加（中位 7），效應量大且穩健——抗藥性升高明確由單一 clade 4 亞族群擴張驅動，而非散在突變。
- Limitation：回溯性實驗室監測未系統性收集病人層級臨床資料（免疫狀態、抗黴菌用藥史、預後）與分母資料（patient-days、抗黴菌藥使用量、感染管制），無法釐清抗藥率消長的成因；WGS 子集由不同框架與目的選取，可能引入選樣偏差；五例同病人多株分析雖顯示 strain replacement 與 dual-clade mixed infection，但僅單一菌落常規操作恐漏檢混合感染中的抗藥變異株。
- Bottom line：中國 C. tropicalis 的 azole 抗藥性已達全球最高（>40%），由 cluster AZR 此一帶 ERG11 Y132F 加 copy number 擴增的優勢 clone 擴張所驅動，臨床應採行 lineage-aware 監測、治療中重複藥敏檢測，並以 One Health 視角強化抗黴菌藥物管理。
Persistent and pathogen-specific infection risk during long-term survivorship after CD19 CAR-T: An Australian multi-centre cohort study¶
Clin Microbiol Infect | IF 8.0 | DOI | [(Reynold2026Persistentpathogenspecific?)]
- 設計：澳洲 5 中心回溯世代研究，以 cause-specific Cox（死亡為競爭風險）分早／中／晚期感染，並用 Firth regression 做敏感度分析。
- 樣本：291 名接受標準照護 CD19 CAR-T 的 aggressive lymphoma 成人（2019–2023），追蹤至 2025/3；逾 1 年可評估者 146 人（中位 600 天，IQR 420–900）。
- 關鍵數字：49.5% 至少一次感染、36% 重度、5% 致死；1 年後 40% 出現晚發感染、18% 重度晚發，RVIs 最常見（37/89 事件）且重度比例未隨時間下降。真菌感染少（6%）但 dexamethasone 累積≥56 mg 可預測（AUC 0.71, p=0.015）。早期感染預測中期感染（OR 2.96）效應中等，真菌閾值 CI 偏寬（1.6–27.1）。
- Limitation：回溯設計、>1 年無可辨識預測因子（事件數少、power 不足），真菌事件僅 17 例估計不穩，單一國家世代、且晚期分析有 immortal-time bias 之虞。
- Bottom line：CAR-T 後感染風險延伸逾 1 年，RVIs 持續為主，累積類固醇暴露者應延長真菌監測與預防。
🔴 Transplant & Opportunistic Infections¶
Population genomics reveals a long-term increase in azole resistance associated with the emerging cluster AZR among Candida tropicalis causing invasive infections¶
Authors: Zhao Y et al. | Journal: Emerg Microbes Infect | Date: 2026 Jun 25
DOI: 10.1080/22221751.2026.2695535
TL;DR: 中國2022至2023年911株Candida tropicalis臨床菌株分析顯示，fluconazole抗藥率已由2009年的5.7%上升至歷史新高43.1%，其中58.6%的抗藥菌株屬於攜帶ERG11突變的cluster AZR。
不嘻嘻：Candida tropicalis的azole抗藥率飆破四成，我們快沒藥用了。
Persistent and pathogen-specific infection risk during long-term survivorship after CD19 CAR-T: An Australian multi-centre cohort study¶
Authors: Reynolds GK et al. | Journal: Clin Microbiol Infect | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1016/j.cmi.2026.06.019
TL;DR: 澳洲291名接受CD19 CAR-T患者中，49.5%發生感染且5%死亡；追蹤逾1年的146人中有40%出現晚期感染，以RVIs最常見，而真菌感染風險與dexamethasone累積暴露量（≥56 mg）顯著相關。
不嘻嘻：做完CAR-T竟然有近半數人感染，看來後續追蹤才是大魔王。
Clinical Characteristics, Management, and 30-Day Mortality Predictors in an 18-Year Pediatric Candidemia Cohort¶
Authors: Ekemen C et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 17
DOI: 10.3390/jof12060445
TL;DR: 土耳其西部18年回顧研究顯示，465例兒童candidemia中以Candida parapsilosis最常見（46%），30天死亡率為10.8%，且未移除導管是死亡的最強獨立預測因子（aOR 6.63）。
不嘻嘻：導管不拔掉死亡風險直接飆六倍，看來每天巡房又有得跟外科吵了。
Overview of Mucormycosis Cases in Türkiye: A Cumulative Case Analysis¶
Authors: Yaşar Duman M et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 17
DOI: 10.3390/jof12060443
TL;DR: 土耳其近60年199例mucormycosis分析顯示，最常見共病為diabetes mellitus（65.8%），並以rhino-cerebral型為主（86.4%）；整體死亡率為43.7%，接受外科清創者死亡率較低。
不嘻嘻：mucormycosis死亡率高達四成，遇到這種難纏對手還是得求助外科。
Recent Outbreaks, Resistance Trends, and Control Measures in Candida auris and Candida glabrata Infections¶
Authors: Raeisi S et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 15
DOI: 10.3390/jof12060436
TL;DR: Candida auris與Candida glabrata多重抗藥威脅增加，前者對azole抗藥率常逾80%且出現echinocandin抗藥，後者則呈現azole與echinocandin雙重抗藥。
不嘻嘻：Candida auris連echinocandin都快防不住，真菌真的要統治世界了。
Extrapulmonary and Other Pneumocystis jirovecii Infections Diagnosed via Fungal Cell-Free DNA Using Giant Magnetoresistance Detection¶
Authors: Young JH et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 15
DOI: 10.3390/jof12060435
TL;DR: 利用血漿cfDNA的GMR技術，成功於腎移植等案例中診斷出肺外及肺部Pneumocystis jirovecii感染，顯示此技術能輔助現行檢驗並提升診斷率。
嘻嘻：用血漿cfDNA的GMR技術就能診斷肺外P. jirovecii，好工具不用嗎？
β-Glucans, Pneumocystis jirovecii and Atherogenic Inflammation: From Pulmonary Immunity to Cardiovascular Risk¶
Authors: Castillo JC et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 14
DOI: 10.3390/jof12060434
TL;DR: Pneumocystis jirovecii的β-glucan能活化Syk-CARD9-NFκB等路徑，促進促發炎單核球/巨噬細胞極化，造成全身性發炎並增加心血管風險。
不嘻嘻：吸入P. jirovecii不只傷肺，還會因為全身性發炎增加心血管風險。
Ten-Year Trends in Candidemia at a Tertiary-Care Hospital in Spain (2015-2024): Epidemiological Shifts, Diagnostic Acceleration, and Impact of Antifungal Stewardship in the COVID-19 and Post-Pandemic Era¶
Authors: Castelló-Abietar C et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 11
DOI: 10.3390/jof12060428
TL;DR: 西班牙306例candidemia分析顯示整體死亡率為40.8%；後期Nakaseomyces glabrata躍升為第二常見菌株，且該菌對fluconazole抗藥率高達48.1%。
不嘻嘻：Nakaseomyces glabrata對fluconazole抗藥率快過半，真的沒藥醫。
Clinical Significance of Serum (1→3)-β-D-Glucan Positivity in Cryptococcosis: A Retrospective Cohort Study¶
Authors: Miyazaki A et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 11
DOI: 10.3390/jof12060427
TL;DR: Cryptococcosis患者若血清BDG呈陽性，常伴隨disseminated disease與高真菌負荷，其90天死亡率顯著高於陰性組（37.5% vs 3.9%）。
不嘻嘻：cryptococcosis患者如果BDG陽性，死亡率直接飆十倍，這資料太驚人。
Can Patients with Hematologic Disease and Prior Mucormycosis Undergo Stem Cell Transplantation?¶
Authors: Leon A et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 11
DOI: 10.3390/jof12060423
TL;DR: 對29例有mucormycosis病史患者的回顧顯示，在血液腫瘤緩解且黴菌感染穩定下，進行HSCT是安全的；追蹤逾12個月的存活率達80%，復發率為17%。
嘻嘻：就算得過mucormycosis，只要感染穩定還是能安全做HSCT，生存率達八成！
In Vivo Evaluation of a Nanoemulsion-Delivered Chromium(III)-Triazole Complex Against Fluconazole-Resistant Candida albicans¶
Authors: Bedoya-Florez MV et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 02
DOI: 10.3390/jof12060403
TL;DR: 小鼠體內試驗顯示，以nanoemulsion傳遞的chromium(III)-triazole複合物（NE-CrL1）能有效降低抗fluconazole之Candida albicans所致腎臟真菌負荷，並減輕組織發炎。
嘻嘻：奈米載體複合物成功擊敗抗藥性Candida albicans，期待人體臨床試驗。
Overview of Risk Factors and Diagnosis of Invasive Candidiasis¶
Authors: Sisu VD et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 May 25
DOI: 10.3390/jof12060383
TL;DR: Invasive candidiasis的早期診斷與風險評估對縮短抗真菌治療延遲至關重要，臨床上需評估宿主風險與菌株特性，並結合新興生物標記以利早期預測。
嘻嘻：結合新興生物標記提早預測invasive candidiasis，有望縮短用藥延遲。
Epidemiology and factors associated with Talaromyces marneffei detection in the mainland of China, 2022-2024: a cross-sectional study of hospitalized patients¶
Authors: Lun X et al. | Journal: BMC Public Health | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1186/s12889-026-28001-z
TL;DR: 中國2,316例住院患者的tNGS分析顯示，Talaromyces marneffei檢出具季節雙峰性，好發於41-50歲男性，常與Pneumocystis jirovecii共同感染，且露點溫度對檢出風險的解釋力達48.55%。
不嘻嘻：Talaromyces marneffei常跟P. jirovecii雙重感染，這到底要怎麼防。
Risk factors and a prediction model of poor prognosis in patients with invasive aspergillosis in a general hospital¶
Authors: Li X et al. | Journal: BMC Infect Dis | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1186/s12879-026-13805-6
TL;DR: 針對307例invasive aspergillosis患者的分析顯示，ICU住院天數、高C-reactive protein、高血糖與腎衰竭為預後不良的獨立風險因子，據此建構的nomogram模型具良好預測效力（AUC為0.810）。
嘻嘻：這個預估invasive aspergillosis預後的模型AUC破零點八，臨床評估好幫手。
Temporal trends and clinical outcomes of pediatric invasive fungal diseases: a ten-year retrospective study from a tertiary-care center in Thailand¶
Authors: Niyomthammarat C et al. | Journal: BMC Infect Dis | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1186/s12879-026-13849-8
TL;DR: 泰國一項10年研究分析171例兒童IFD顯示，以invasive aspergillosis及invasive candidiasis最常見，部分病例在接受antifungal prophylaxis下仍發病，且90天死亡率介於12.9%至24.8%。
不嘻嘻：兒童用了抗真菌藥預防照樣發病，死亡率還不低，真菌防線真難守。
Clinical Characteristics and Risk Factors for Cryptococcal Meningitis in Non-Acquired Immunodeficiency Syndrome Patients with Pulmonary Cryptococcosis: A 12-Year Hospital-Based Study¶
Authors: Dang X et al. | Journal: Pathogens | Date: 2026 May 22
DOI: 10.3390/pathogens15060560
TL;DR: 對101例非AIDS的pulmonary cryptococcosis患者分析顯示，17.8%併發cryptococcal meningitis（CM）；合併共病、hypoglobulinemia與hypokalemia為併發CM的獨立風險因子（共病OR=7.246）。
不嘻嘻：非AIDS的肺部感染仍有近兩成進展為腦膜炎，千萬不能掉以輕心。
Serological, Molecular, and Epidemiological Investigation of Toxoplasma gondii Infection in Blood Donors from the Brazilian Semiarid Region¶
Authors: Lima Neto BF et al. | Journal: Trop Med Infect Dis | Date: 2026 Jun 17
DOI: 10.3390/tropicalmed11060163
TL;DR: 巴西646名捐血者檢測顯示，Toxoplasma gondii的IgG陽性率為43.4%，IgM為0.3%，PCR皆為陰性，顯示輸血傳播風險低；年齡與salad washing為其主要相關因子。
嘻嘻：捐血傳播Toxoplasma gondii風險極低，但沙拉還是要洗乾淨再吃喔。
The Impact of HIV Viral Suppression and Immune Status on Rifampicin-Resistant Tuberculosis Outcomes: A Systematic Review and Meta-Analysis Protocol¶
Authors: Mphahlele T et al. | Journal: Trop Med Infect Dis | Date: 2026 Jun 15
DOI: 10.3390/tropicalmed11060160
TL;DR: 此系統性回顧與meta-analysis計畫書將評估HIV的viral suppression、CD4免疫狀態及抗藥性對rifampicin-resistant tuberculosis（RR-TB）患者治療預後的具體影響。
不嘻嘻：HIV合併抗藥性結核病這個世紀難題，目前看來還是只能先做系統性回顧。
Clinical Features, Treatment, and Outcomes of Mucormycosis: A Retrospective Analysis of 13 Cases from a Single Center in Turkey (2015-2025)¶
Authors: Kepenek Kurt E et al. | Journal: Trop Med Infect Dis | Date: 2026 Jun 03
DOI: 10.3390/tropicalmed11060152
TL;DR: 土耳氣單一中心13例mucormycosis患者分析顯示，共病以血液腫瘤（53.9%）與糖尿病最常見；在合併liposomal amphotericin B與手術治療下，整體死亡率仍高達61.5%。
不嘻嘻：就算手術加liposomal amphotericin B，mucormycosis死亡率仍破六成。
Association between Epstein-Barr Virus viremia and cardiac function in children and young adults with perinatally acquired HIV¶
Authors: Curtis SF et al. | Journal: Cardiovasc J Afr | Date: 2026 May 08
DOI: 10.5830/CVJA-2025-109
TL;DR: 肯亞針對垂直感染HIV之兒童與青年的研究顯示，體內是否檢出EBV viremia，在早期心臟功能指標上並無顯著統計學差異（p值均>0.05）。
嘻嘻：幸好EBV viremia沒有影響垂直感染HIV孩童的早期心臟功能，鬆了一口氣。
Protective Effect Against Acute Experimental Toxoplasmosis Conferred by Intranasal Immunisation with Toxoplasma gondii Membrane Proteins Plus CpG Adjuvant¶
Authors: Brito C et al. | Journal: Vaccines (Basel) | Date: 2026 Jun 17
DOI: 10.3390/vaccines14060539
TL;DR: 小鼠體內試驗顯示，以Toxoplasma gondii膜蛋白（TGMP）合併CpG佐劑進行鼻腔免疫，能顯著誘導特異性IgG、IgA與IFN-γ記憶T細胞，並有效減少感染後的器官寄生蟲負荷。
嘻嘻：用鼻噴疫苗就能誘導免疫並減少Toxoplasma gondii感染，期待臨床試驗。
Therapeutic Vaccines for Chronic Viral Infections: From Immune Modulation to Clinical Translation¶
Authors: Li Z et al. | Journal: Vaccines (Basel) | Date: 2026 Jun 04
DOI: 10.3390/vaccines14060507
TL;DR: 針對HBV、HCV、HIV等慢性病毒感染的治療性疫苗研發，目前受限於T細胞耗竭與局部免疫耐受；複合療法（如結合降低病毒量與阻斷抑制性路徑）為未來臨床轉譯之關鍵趨勢。
不嘻嘻：慢性病毒治療性疫苗卡在T細胞耗竭，看來複合療法才是未來的路。
Patterns of Infectious Disease Identified in Clinical Autopsy at a South African Tertiary Care Setting: A 10-Year Retrospective Study¶
Authors: Khaba MC et al. | Journal: Diseases | Date: 2026 Jun 19
DOI: 10.3390/diseases14060221
TL;DR: 南非55例感染症死者的10年病理解剖分析顯示，中位年齡為31歲，HIV盛行率為35%（68%接受ART）；最主要死因為multilobar pneumonia（36%），且有60%的死者為HIV陰性。
不嘻嘻：解剖發現感染症頭號殺手是嚴重肺炎，而且過半死者根本沒有HIV。
Distinct immune responses to HIV and CMV in Hofbauer cells across gestation highlight evolving placental immune dynamics¶
Authors: Schuch V et al. | Journal: Front Immunol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fimmu.2026.1832988
TL;DR: 體外試驗顯示，胎盤Hofbauer cells對HIV-1與CMV的免疫反應受懷孕週數影響；足月時兩者皆能誘發interferon反應，但CMV會特異性抑制細胞的粒線體、脂質代謝與WNT訊息傳遞路徑。
不嘻嘻：CMV會特異性破壞胎盤免疫細胞的代謝路徑，難怪對胎兒傷害這麼大。
Risk Factors for Tuberculosis in Elderly: Prevalence and Population-attributable Risk¶
Authors: Ravichandran RS et al. | Journal: Indian J Community Med | Date: 2026
DOI: 10.4103/ijcm.ijcm_664_24
TL;DR: 印度214名老年人（>60歲）調查顯示，以GLIM評估的營養不良盛行率為20.1%，糖尿病為31.8%；在TB風險的PAF中，以營養不良（15%）影響最大，其次為糖尿病（11%）。
不嘻嘻：老年人防結核除了控血糖，居然是營養不良影響最大，要多吃飯啊。
Invasive aspergillosis in autoimmune inflammatory rheumatic diseases: epidemiology, risk factors, diagnosis, management and challenges¶
Authors: Liang P et al. | Journal: Ann Med | Date: 2026 Dec
DOI: 10.1080/07853890.2026.2685285
TL;DR: AIIRD患者合併invasive aspergillosis（IA）的通報死亡率高達25%至85%；其臨床症狀與影像表現常與風濕疾病活性混淆，建議結合早期微生物學檢測與影像學以利早期診斷。
不嘻嘻：風濕免疫病患併發IA死亡率最高達八成五，症狀還跟原本疾病超像。
Corticosteroids in immunocompromised ICU patients with pneumonia: risks, evidence, and clinical practice¶
Authors: Morales-Olivera JA et al. | Journal: Pneumonia (Nathan) | Date: 2026 Jun 25
DOI: 10.1186/s41479-026-00202-5
TL;DR: 針對免疫不全併sCAP的ICU患者，使用corticosteroids應個體化，以防增加opportunistic superinfection風險；此療法僅在AIDS併嚴重PJP中證實有mortality benefit。
不嘻嘻：免疫不全肺炎用類固醇容易引來伺機性感染，只有嚴重PJP併AIDS才有效。
🟢 One Health / Zoonoses¶
Addressing the zoonotic threat of merbecoviruses¶
Authors: Li X et al. | Journal: Nat Microbiol | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1038/s41564-026-02397-1
TL;DR: Betacoronavirus屬之merbecoviruses除使用DPP4受體外，部分成員亦能結合ACE2或APN受體，擴大了宿主範圍；此受體特性有助於開發廣效抗病毒藥與疫苗。
嘻嘻：摸透merbecoviruses的多元受體機制，研發廣效疫苗終於有方向了。
Genomic Basis of Zoonotic Transmission and Antifungal Resistance in Microsporum canis¶
Authors: Du Z et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 Jun 11
DOI: 10.3390/jof12060429
TL;DR: 北京38株寵物來源Microsporum canis的基因組分析證實人畜共通傳播，並發現terbinafine活性最高，但有11株呈多重高MIC表型，且CDR1基因複本數增加與多重抗藥相關。
不嘻嘻：寵物傳染的Microsporum canis出現多重抗藥性，以後抱貓狗要小心了。
A broader perspective on antimicrobial resistance in food chains¶
Authors: Mølbak K et al. | Journal: NPJ Antimicrob Resist | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1038/s44259-026-00242-3
TL;DR: 現行食品鏈AMR監測偏重易引發outbreak的病原，低估了造成定殖、遲發性腸外感染或透過horizontal gene transfer傳播的resistome對人類健康的實質威脅。
不嘻嘻：只盯著常見食品致病菌會漏掉隱藏的抗藥基因庫，這監測盲點太大了。
Host-pathogen interplay of Orientia tsutsugamushi: pathomolecular epidemiology and phylo-immuno profiling in naturally infected rodents and shrews¶
Authors: Mote AB et al. | Journal: Microb Pathog | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1016/j.micpath.2026.108656
TL;DR: 印度261隻小哺乳動物的nested PCR檢測顯示，Orientia tsutsugamushi盛行率為11.9%，雨季及農村顯著較高；基因分析鑑定出4種流行菌株，並呈現不同的病理特徵。
不嘻嘻：印度野外齧齒類帶有Orientia tsutsugamushi比例不低，雨季去農村要小心。
A single-center study of a waterborne tularemia outbreak among adults and children in Turkiye¶
Authors: Mert K et al. | Journal: BMC Infect Dis | Date: 2026 Jun 25
DOI: 10.1186/s12879-026-13870-x
TL;DR: 土耳其56例水介性tularemia outbreak分析顯示，成人與兒童皆以oropharyngeal型為主；成人LAP較多且療程較長，兒童則易呈現腹痛與leukocytosis。
不嘻嘻：水源污染引發tularemia疫情，大人小孩喉嚨痛到爆，水質安全太重要。
Enhancing data collection on socio-behavioural exposure pathways for emerging tickborne disease through engagement with surviving cases and their household members¶
Authors: Hattori C et al. | Journal: Int J Infect Dis | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1016/j.ijid.2026.108914
TL;DR: 日本長崎針對22名SFTS倖存者及其家屬的問卷顯示，受試者對SFTSV暴露途徑的填答一致性中位數達88.5%，證實了納入多元傳播途徑問卷設計的可信度。
嘻嘻：透過問卷能高精準還原SFTSV的暴露途徑，這對未來防堵疫情很有幫助。
Human Orthohantavirus Infections: A Narrative Review¶
Authors: Duque V | Journal: Pathogens | Date: 2026 Jun 22
DOI: 10.3390/pathogens15060652
TL;DR: Orthohantavirus為人畜共通病原，以齧齒目為自然宿主；感染後可引起HFRS或HCPS，導致急性全身性血管失調與器官衰竭。
不嘻嘻：Orthohantavirus會引發急性血管失調和器官衰竭，齧齒類真的要離遠點。
Molecular Detection of Coxiella-like Endosymbionts in Ticks in Hebei, China¶
Authors: Xu ZY et al. | Journal: Pathogens | Date: 2026 Jun 18
DOI: 10.3390/pathogens15060647
TL;DR: 中國河北947隻Haemaphysalis longicornis蜱蟲中，8.24%的IS1111 PCR呈陽性；基因分析證實其攜帶者為Coxiella-like共生菌而非Coxiella burnetii。
嘻嘻：幸好蜱蟲帶的是Coxiella-like共生菌而不是Q熱病原，虛驚一場。
Ticks and Tick-Borne Microorganisms in Australian Wildlife: A Scoping One Health Evidence Synthesis of Reported Associations and Knowledge Gaps¶
Authors: Brar K et al. | Journal: Pathogens | Date: 2026 Jun 18
DOI: 10.3390/pathogens15060646
TL;DR: 澳洲133項研究的One Health整合分析顯示，50種蜱蟲寄生於160種野生動物，常見蜱種如Ixodes tasmani與Ixodes holocyclus，但目前分子鑑定與病原篩檢仍有限。
不嘻嘻：澳洲野生動物滿身蜱蟲，我們對其攜帶的病原卻還是一知半解。
Combining PCR and Metagenomic Approaches to Reveal Tick-Borne Pathogens in Ticks Collected from Livestock and Companion Animals in Cambodia¶
Authors: Yean S et al. | Journal: Pathogens | Date: 2026 Jun 16
DOI: 10.3390/pathogens15060641
TL;DR: 柬埔寨1,526隻蜱蟲分析顯示，牛隻的Rhipicephalus microplus攜帶Anaplasma marginale（1.1%）與Ehrlichia minasensis（0.9%），犬隻的Rhipicephalus linnaei則帶有Babesia canis（2.0%）。
不嘻嘻：柬埔寨蜱蟲帶了一堆Anaplasma跟Babesia，牛狗的防蜱工作得加強。
Rapid Culture-Independent Detection of Fish Pathogens Using Oxford Nanopore Technologies: Case-Based Insights Across Multiple Species and Tissues¶
Authors: Wojnarowski K et al. | Journal: Pathogens | Date: 2026 Jun 10
DOI: 10.3390/pathogens15060622
TL;DR: 利用Oxford Nanopore Technologies（ONT）定序技術，無須培養即可直接且快速鑑定魚類組織中的Streptococcus iniae與Aeromonas hydrophila等多重病原。
嘻嘻：用ONT定序免培養就能直接抓出魚類多重病原，這診斷速度真的快。
Reducing Antibiotic Dependence in Poultry: The Potential of Phytochemicals as Antibiotic Alternatives Against Bacterial Foodborne Pathogens¶
Authors: Chandran R et al. | Journal: Trop Med Infect Dis | Date: 2026 Jun 04
DOI: 10.3390/tropicalmed11060153
TL;DR: Phytochemicals（PCs）具有破壞細菌膜與抑制quorum sensing等機制，可減少家禽體內Salmonella enterica與Campylobacter spp.定殖，為抗生素替代選擇。
嘻嘻：植化素能破壞膜還能抑制quorum sensing，看來養雞場有望少用點抗生素。
Application of high hydrostatic pressure on the microbial and physicochemical characteristics of pork¶
Authors: Baek UB et al. | Journal: Food Sci Anim Resour | Date: 2026 Jun 25
DOI: 10.1007/s44463-026-00091-8
TL;DR: HPP（500 MPa、15分鐘）處理生豬肉，能將Salmonella Typhimurium與Listeria monocytogenes降至無法檢出，有效滅菌但亦會引起蛋白質變性等物化改變。
嘻嘻：HPP能把Salmonella直接打到偵測不到，雖然肉質會變但食安有保障。
Genomic characterization and comparative analysis of multidrug-resistant Salmonella Indiana sequence type 17 carrying mcr-9.1 in retail eggs from the United Arab Emirates¶
Authors: Habib I et al. | Journal: Front Vet Sci | Date: 2026
DOI: 10.3389/fvets.2026.1825641
TL;DR: 阿拉伯聯合大公國380盒蛋檢測中有9.7%呈Salmonella陽性；其中2株S. Indiana ST17攜帶mcr-9.1基因，但對colistin仍具敏感性。
不嘻嘻：零售雞蛋檢出帶有mcr-9.1的S. Indiana，幸好對colistin還算敏感。
Bacterial contamination and prevalence of antibiotic-resistant Escherichia coli and Salmonella isolated from raw pork and chicken meat from slaughterhouses and retail markets in Kenya¶
Authors: Nyanja MN et al. | Journal: Vet World | Date: 2026 May
DOI: 10.14202/vetworld.2026.1867-1887
TL;DR: 肯亞320份生肉樣本中，Escherichia coli檢出率為61.6%，Salmonella為7.2%；87.3%的E. coli具多重抗藥性，Salmonella對ciprofloxacin抗藥率最高。
不嘻嘻：肯亞生肉的E. coli八成多具多重抗藥性，連ciprofloxacin也快失守。
🟡 Food Security / Food Safety¶
Global high-resolution mapping of seagrass to support conservation¶
Authors: Peng J et al. | Journal: Nature | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1038/s41586-026-10704-3
TL;DR: 首份全球10公尺高解析度海草分布圖鑑定出148,506平方公里的海草，並指出在4年內全球海草面積已流失4%。
不嘻嘻：連海草四年內都流失了百分之四，大自然的生態防線也快失守了。
Multi-modal sensor based on ANTS/MgFe-LDH nanocomposite combined with machine learning for the intelligent recognition of antioxidants and metal ions¶
Authors: Wu Y et al. | Journal: Food Chem | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1016/j.foodchem.2026.150169
TL;DR: 基於LDH奈米酶的多模態感測器結合Random Forest演算法，可智慧識別食品基質中9種常見抗氧化劑與金屬離子，準確率達96.3%。
嘻嘻：用奈米酶感測器配機器學習辨識食品添加物，準確率破九成六，食安新利器。
EndoNUclease Heteroduplex cleavage typing a new technique for rapid typing of bacterial isolates in the context of nosocomial outbreaks: proof of concept with Bacillus cereus¶
Authors: Maalouf E et al. | Journal: Front Cell Infect Microbiol | Date: 2026
DOI: 10.3389/fcimb.2026.1813523
TL;DR: ENUHCT能作為Bacillus cereus分型中替代MLST的快速方案，無須定序即可在數小時內提供與MLST相符的結果，但當SNP數≥4時準確度降低。
嘻嘻：免定序幾小時內就能完成Bacillus cereus分型，院內感控的救星來了。
Investigating the Genetic and Molecular Basis of Melanin and Edible Quality in Auricularia cornea¶
Authors: Cui Y et al. | Journal: J Fungi (Basel) | Date: 2026 May 23
DOI: 10.3390/jof12060381
TL;DR: 針對138株Auricularia cornea分析顯示，黑色素含量升高會增加硬度與膠質性，但降低彈性；並鑑定出多個參與黑色素合成與細胞壁結構的關鍵基因。
嘻嘻：摸透木耳黑色素與口感的基因奧秘，以後挑木耳有科學依據了。
Atypical genomic features among Listeria monocytogenes strains isolated from the pig manure management chain¶
Authors: Lagarde J et al. | Journal: Sci Rep | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1038/s41598-026-53477-5
TL;DR: 分析豬糞處理鏈中371株Listeria monocytogenes，在CC77 clonal complex中發現新型LGI3基因島，且有7%菌株具染色體tetracycline抗藥性。
不嘻嘻：豬糞處理鏈裡藏著抗藥性Listeria monocytogenes，環境抗藥性不容小覷。
Understanding farmers' resistance to improved rice cultivars: insights from Northern Iran¶
Authors: Moumenihelali H et al. | Journal: Sci Rep | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1038/s41598-026-59554-z
TL;DR: 伊朗農民對改良稻米品種（IRCs）推廣的阻力主要源於售價失衡、知識分享系統不健全、市場接受度低，以及農民避險心理。
不嘻嘻：推廣改良水稻還得克服農民的避險心理，看來改變習慣比改基因還難。
A water and land resources multi-objective optimal allocation model based on ecological, economic and social sustainability using NSGA-III¶
Authors: Zhang L et al. | Journal: Sci Rep | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1038/s41598-026-59269-1
TL;DR: 吉林西部水土資源配置模型顯示，利用NSGA-III進行生態-經濟-社會（EES）協同最佳化，能在僅微幅減少0.10%生態效益下提升經濟與社會效益。
嘻嘻：用NSGA-III模型最佳化吉林水土資源配置，生態與經濟雙贏的典範。
Consumer-oriented CSR practices and food safety perceptions: a stakeholder and signaling theory perspective¶
Authors: Zhao M et al. | Journal: Sci Rep | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1038/s41598-026-57466-6
TL;DR: 中國498名連鎖餐廳消費者調查顯示，產品安全與道德採購等CSR作為能提升食安認知；此影響受滿意度中介與忠誠度調節。
嘻嘻：餐廳做好社會責任真的能提升消費者的食安認知，誠信經營果然有效。
Deep learning integrated plasmonic electrochemical sensing for fast and accurate pathogen detection¶
Authors: Mansour S et al. | Journal: Sci Rep | Date: 2026 Jun 24
DOI: 10.1038/s41598-026-55102-x
TL;DR: 結合深度學習與plasmonic電化學感測，可在10分鐘內偵測E. coli、Salmonella與S. aureus，LOD達0.12至0.21 pg/mL，且分類準確率達95.6%。
嘻嘻：結合電化學與深度學習，十分鐘就能驗出E. coli等致病菌，太有效率了。
AI-Driven Patulin Detection in Apple Using Machine Learning Coupled With Surface-Enhanced Raman Spectroscopy¶
Authors: Ashiagbor K et al. | Journal: J Food Sci | Date: 2026 Jun
DOI: 10.1111/1750-3841.71250
TL;DR: 利用SERS技術結合機器學習預測蘋果中的patulin（PAT）濃度，以UVE-SVM及GA-SVM模型預測力最佳（RPD分別為4.0487與4.3036）。
嘻嘻：用SERS光譜加上機器學習精準驗出蘋果的黴菌毒素，科技防毒真厲害。
Lactulose-Induced Transcriptional Reprogramming and Repression of Persistence-Associated Phenotypes in Non-Typhoidal Salmonella enterica¶
Authors: Ahmed J et al. | Journal: Pathogens | Date: 2026 Jun 01
DOI: 10.3390/pathogens15060592
TL;DR: 針對Salmonella Kentucky分析顯示，lactulose能誘導NTS代謝基因網絡，並顯著抑制其運動力與biofilm形成等與環境持久性相關的表型。
嘻嘻：沒想到lactulose能抑制Salmonella的運動與生物膜，老藥新用又有新希望。
Analyses of the microbial safety and physicochemical characteristics of beef loin treated with high-pressure¶
Authors: Baek UB et al. | Journal: Food Sci Anim Resour | Date: 2026 Jun 25
DOI: 10.1007/s44463-026-00081-w
TL;DR: HPP（500 MPa、15分鐘）處理生牛肉，能使Salmonella Typhimurium降至低於偵測極限（<1 log CFU/g），提升食安但會改變肉色與質地。
嘻嘻：高壓處理能把牛肉裡的Salmonella徹底殺光，雖然肉色跟質地會變。
資料來源：PubMed (articles retrieved 2026-06-26)